Mechanism of action of cyclic antimicrobial peptides

DSpace/Manakin Repository

Show simple item record

dc.contributor Universitat de Girona. Institut de Química Computacional
dc.contributor Universitat de Girona. Departament de Química
dc.contributor.author Díaz i Cirac, Anna
dc.date.issued 2011-07-01
dc.identifier.other DL Gi.1303-2011
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10803/38252
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10256/4879
dc.description.abstract This PhD thesis is the result of the combination of experimental and computational techniques with the aim of understanding the mechanism of action of de novo cyclic decapeptides with high antimicrobial activity. By experimental techniques the influence of the replacement of the phenylalanine for tryptophan residue in their antimicrobial activity was tested and the stability in human serum was also analyzed, in order to evaluate their potential therapeutic application as antitumor agents. On the other hand, the interaction amongst the peptide BPC194 c(KKLKKFKKLQ), the best candidate from the whole library of cyclic peptides, and a model anionic membrane was simulated. The results showed a structure-function relationship derived from the stable conformation of the peptides involved in the membrane permeabilization. As a result, a rational design was performed being BPC490 the peptide with best antimicrobial activity compared with the best active peptide from the original library.
dc.description.abstract Aquesta tesi doctoral resulta de la combinació d’estudis mitjançant tècniques experimentals i computacionals amb l’objectiu d’entendre el mecanisme d’acció de "de novo" decapèptids cíclics amb elevada activitat antimicrobiana. Experimentalment, es va avaluar la influència de la substitució dels residus de fenilalanina per triptòfan en la seva activitat antimicrobiana i també la seva estabilitat sèrum humà, per tal de valorar la seva possible aplicació terapèutica envers el càncer. Per altra banda, es va simular la interacció del pèptid BPC194 c(KKLKKFKKLQ), millor candidat de la biblioteca de pèptids cíclics, amb models aniònics de bicapa lipídica. Els resultats van posar en manifest una relació estructura-funció derivada de la conformació estable dels pèptids que participen directament en la permeabilització de la membrana. Es va procedir doncs al disseny racional de nous pèptids cíclics sent el pèptid BPC490 el que va presentar una millor activitat bacteriana en comparació amb el pèptid més actiu de la llibreria original.
dc.format.mimetype application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat de Girona
dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject.other Cyclic peptides
dc.subject.other Pèptids cíclics
dc.subject.other Péptidos cíclicos
dc.subject.other Structure-function relationship
dc.subject.other Relació estructura-funció
dc.subject.other Relación estructura-función
dc.subject.other Antimicrobial peptides
dc.subject.other Pèptids antimicrobials
dc.subject.other Péptidos antimicrobiales
dc.subject.other De novo design
dc.subject.other Molecular dynamics
dc.subject.other Dinàmica molecular
dc.subject.other Dinámica molecular
dc.subject.other Bacterial membrane
dc.subject.other Membrana bacterial
dc.title Mechanism of action of cyclic antimicrobial peptides
dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.rights.accessRights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.contributor.director Salvador Sedano, Pedro
dc.contributor.director Planas i Grabuleda, Marta
dc.contributor.director Feliu Soley, Lídia
dc.subject.udc 544 - Química física
dc.type.version info:eu-repo/semantics/publishedVersion


Files in this item

 

Show simple item record

Search DUGiDocs


Browse

My Account

Statistics