Basis set superposition error effects, excited-state potential energy surface and photodynamics of thymine

DSpace/Manakin Repository

Show simple item record

dc.contributor Universitat de Girona. Institut de Química Computacional
dc.contributor.author Asturiol Bofill, David
dc.date.issued 2010-02-05
dc.identifier.isbn 9788469319901
dc.identifier.other DL Gi.322-2010
dc.identifier.uri http://www.tdx.cat/TDX-0305110-113416
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10803/7943
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10256/4871
dc.description.abstract En aquesta tesi he estudiat l'efecte de l'error de superposició de base (BSSE) en la planaritat d'algunes molècules. He observat que l'ús d'alguns mètodes de càlcul amb determinades funcions de base descriuen mínims d'energia no planars per les bases nitrogenades de l'ADN. He demostrat que aquests problemes es poden arreglar utilitzant el mètode Counterpoise per corregir el BSSE en els càlculs. En aquesta tesi també he estudiat la fotofísica de la timina i els resultats mostren que existeixen dos camins de relaxació des de l'estat excitat que permeten la regeneració de l'estructura inicial de forma ultraràpida.
dc.description.abstract The effect of the basis set superposition error (BSSE) on the planarity of some molecules has been studied in this thesis. I have observed that the use of some correlated methods with certain basis sets lead to non-planar minima structures of nucleobases. I have shown that the use of the Counterpoise method fixes these pitfalls in all cases. I have also studied the photophysics of thymine in this thesis and my results show that there exist two decay paths that can regenerate the initial structure of thymine in less than tenths of picoseconds upon photon absorption.
dc.format.mimetype application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat de Girona
dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject.other Photophysics
dc.subject.other Fotofísica
dc.subject.other Thymine
dc.subject.other Timina
dc.subject.other Counterpoise method
dc.subject.other Método Counterpoise
dc.subject.other Mètode Counterpoise
dc.subject.other Set superposition error
dc.subject.other Error de superposición de base
dc.subject.other Error de superposició de base
dc.title Basis set superposition error effects, excited-state potential energy surface and photodynamics of thymine
dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.rights.accessRights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.contributor.director Salvador Sedano, Pedro
dc.contributor.director Duran i Portas, Miquel
dc.contributor.director Blancafort San José, Lluís
dc.subject.udc 544 - Química física
dc.type.version info:eu-repo/semantics/publishedVersion


Files in this item

 

Show simple item record

Search DUGiDocs


Browse

My Account

Statistics